Para além do acesso ao Mestrado (2.º Ciclo) em Consulta Psicológica, Aconselhamento e Psicoterapia, os estudantes do curso de Aconselhamento Psicossocial têm acesso aos cursos de Mestrado (2.º Ciclo) em funcionamento no ISMAI, dos quais destacamos:

- Neuropsicologia Clínica: Avaliação e Intervenção Neuropsicológicas;
- Consulta Psicológica, Aconselhamento e Psicoterapia;
- Psicologia Clínica e da Saúde;
- Psicologia Escolar e da Educação;
- Psicologia da Saúde Ocupacional;
- Psicologia da Justiça;
- Psicologia da Sexualidade.